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PacBio SMRT测序技术揭示第七次霍乱大流行致病菌的来源
在今天向大家介绍的文章中,作者基于高质量的全基因组测序,对当前所有第七次流行的菌株,包括第七次大流行开始时分离的菌株进行了分析,建立了一个高质量的系统发生树,描绘了发生遗传变化的六个阶段,并得到了三个清晰的生态型,其中包括了非致病性的环境性霍乱弧菌。而第七次大流行霍乱菌株的进化包括了一些获得性基因介导的重要变化,而这些基因被认为是来源于环境中的霍乱弧菌,并且在第六次大流行的菌株中也出现过。这说明此前致病性的霍乱弧菌对第七次大流行的霍乱弧菌致病性的形成与进化有着重要的作用。
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