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肿瘤cfDNA纯化,您有进行reference materials方法学评估吗? 原创 基因市场部 基因快讯 昨天

版权所有,转载请联系基因市场部
2020-04-16

 在细胞凋亡和代谢过程中,正常细胞或异常细胞通过信号途径、坏死或囊泡形成等方式向血液中释放DNA。癌细胞中脱落的循环肿瘤DNA (ctDNA)往往含有肿瘤相关的生物标志物,可用于无创检测和癌症监测。ctDNA相关的检测方法和仪器正在迅速发展,为提高灵敏度和特异性,利用reference materials进行不同检测方法分析和评估,越来越重要。

     2019年7月National Institute of Standards and Technology(NIST) 联合National Cancer Institute 在The Journal of Molecular Diagnostics发表文章提出reference materials多实验室评估是肿瘤cfDNA不同测量方法分析并确保其质量保证的有效工具。





        作者将含有40个癌症基因变异体以四种不同的等位基因频率(VAFs): 2%、0.50%、0.125%和0%混入野生型DNA中,片段化后作为reference material,模拟循环野生型和肿瘤DNA在合成血浆基质中的大小分布。从这些样本中提取DNA,用不同的方法和在多个实验室进行鉴定。结果表明不同提取方法由于化学组份和提取原理的不同,对得率的影响显著(如下表)。其中NucleoSnap DNA Plasma Kit(Macherey-Nagel,740300.50)和QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit (Qiagen, 55114) 提取效果更佳。

NucleoSnap DNA Plasma Kit(Macherey-Nagel,  740300.50)

QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit (Qiagen, 55,114)

Promega Maxwell RSC LV cfDNA Custom Kit (Promega, AX1115)

QIAsymphony DSP Circulating DNA Kit (Qiagen, 937556)

Zymo Quick-cfDNA Serum & Plasma kit (Zymo,D4076)




NucleoSnap® DNA Plasma




        来自德国核酸纯化专家MN公司,更大的上样量,更快的速度,更好的提取效果,帮助您获得更高质量的cfDNA。

01

快速


       采用真空抽滤方法,整个抽提过程仅需45min。

02

不需要Carrier RNA


      利用优化的试剂配方,使整个提取过程中不需要Carrier RNA,避免通过吸光光度测定方法带来的定量不准确和下游检测中的干扰。


03

起始上样量大


       通过 Snap-off 可分离纯化柱,样本起始量更高可达到10 ml。

04

可处理样本类型广


       除了血浆血清中游离核酸纯化外,也可用于尿液中游离核酸分离。




高通量游离核酸产品纯化产品




NucleoSpin® 96 DNA Plasma

样本起始量1-2ml,同时提取96个样本

NucleoMag® DNA Plasma

采用MN磁珠- 超顺磁性,可处理1-10mL血浆样品,形式也更灵活。


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