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简单快速高性价比实现微生物组学从样本制备到菌株水平鉴定
如果你是微生物组学专家需要提高研究成果，而： ——目前的方法难以分析难裂解微生物如Gram+菌； ——需要测序许多样本并且增加数据产出； ——短16S扩增子不能区分菌株并且限制了实验结论； 如果你做转化医学需要确定菌株来了解病原性，而： ——由于16S短扩增子的限制只能鉴别到门或属； ——目前针对16S区域测序的短读长在数据分析时易丢失数据； ——用于菌株Strain ID 鉴别的Shotgun 宏基因组测序成本高且需要信息学专业知识； 如果你是刚刚开始微生物测序，需要更快速的发表更好的数据，而： ——目前的方法又繁琐又难； ——没有信息学专业知识来设计PCR引物或分析数据； ——数据太少不适合发表； 如果你的样本量非常少，而： ——目前的样本制备方法对于微量样本如皮肤、拭子、昆虫、组织活检样本，得率太低； ——处理步骤太多，导致样本损失，微生物检测受限； 现在基因有限公司的合作伙伴Shoreline Biome来了！这是一家位于Farmington的致力于微生物组学研究解决方案的公司，Shoreline Biome提供从微生物样本制备到数据分析的全套解决方案： 样本制备到数据分析全套解决方案 提供市面的一个试剂盒包含微生物裂解到DNA提取到PCR扩增全套易用方案，从样本裂解到纯化到扩增，所有试剂盒都是一样的处理流程，减少使用不同厂家的批间差异，下游测序可选illumina或者Pacbio平台； 市面上一款针对三代测序Pacbio的微生物16S-23S 全读长扩增 StrainID kit，鉴定到株（strain）成为可能； 提供从核酸提取到PCR扩增和配套的微生物生信分析软件，可以使研究者更好的利用NGS技术实现菌株水平的微生物鉴定； 简单快速裂解样本，低样本起始量； 即用型双端barcode PCR引物，高保真一步法PCR； Shoreline Biome 微生物组学全套解决方案 试剂盒特点 裂解难裂解的微生物； 提取高质量高分子量DNA； 充分考虑核糖体RNA结构和功能的智能引物设计，确保完整的微生物覆盖度； 的引物设计减少扩增偏好性 一步法PCR添加独特的双端barcodes，减少index hopping ，增加有效reads。 Microbe ID：Strain ID 成功鉴别了所有137种E.Coli 菌株，并且找到了新菌株。 SBanalyzer software分析软件 Demultiplexes，更大化增加有效reads； 菌株水平微生物鉴定； 识别并binning新菌株； 依据Athena参考数据库。 SBanalyzer software分析软件 想了解更多微生物组学研究方法？想要使您的微生物组学研究更进一步？撮下方阅读原文链接观看由Shoreline Biome 联合创始人和首席科学家Mark Driscoll, Ph.D主讲的“Simple Microbe analysis”讲座吧！ Simple Microbe Analysis with the Shoreline Complete StrainID Kit 主讲人：Mark Driscoll, Ph.D Shoreline Biome 联合创始人，首席科学家 Shoreline 完整的StrainID kit、SBanalyzer software、Athena数据库是个全面、快速、便宜的对所有微生物进行菌株水平定位的方案。Mark Driscoll, Ph.D 带你了解这一新的简便微生物组学流程和分析方案。
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