对于FFPE样本核酸抽提，是否总是有那么点不尽如人意？FFPE样本是目前疾病分子层面及临床研究的重要样本来源，往往下游需要进行文库构建测序来获取更多疾病信息，但提取的核酸质量常导致文库构建失败或缺失很多信息。面对大家对FFPE样本核酸提取质量日益增长的需求，Covaris  truXTRAC FFPE 核酸提取解决方案来帮您，一起来看看对比传统抽提方法它有什么不同之处吧！（下拉还有独家秘密视频放送，直观解析Covaris 超声如何高效主动脱蜡！）

1.取样只收集想要的组织区域！

常规对于FFPE玻片样本收集，都是用刀片全部刮取下来。但有时候只想要癌组织部分，不想要癌旁部分，这时候咋整？

 Covaris 贴心小工具 tissuePICK来帮您！专为从玻片上收集FFPE样本组织而设计，惰性材质，不参与任何反应，超小截面和独特的表面特性，黏附力强，像笔一样使用方便，告别手术刀导致的多余石蜡和组织区域的刮取，只收集想要的区域，使石蜡组织收集更有效率，帮助提高核酸得率，减少样本损失！

2.脱蜡更彻底！

还在用二甲苯、矿物油等脱蜡？其实二甲苯不仅对生物党们身体有毒，而且脱蜡又不彻底，稍微厚一点的（>10μm）组织切片就难以渗透，脱蜡效率就更低了。相信很多人要重复脱两遍蜡的时候。蜡脱不彻底会咋样？石蜡就成了阻碍阻碍下一步蛋白酶K消化的屏障，所以组织消化也不够咯，此外，二甲苯还容易造成核酸降解，本就量少的FFPE样本其实这么一折腾更后的核酸得率质量都受很大影响，也许很多意想不到的基因信息就这么不经意的丢失了。

Tips：Covaris引入独门绝技 AFA（Adaptive Focused Acoustics，自动聚焦声波技术)超声来对FFPE样本进行超声乳化脱蜡，想象一下，有聚焦超声的帮助，裂解液和蛋白酶K能够由内而外、由外向内的全方位无死角侵入组织内部脱蜡乳化、组织消化，这样纳米级别的处理当然使得样品脱蜡消化更彻底啦！这是Covaris FFPE核酸提取优于传统试剂盒的一个独门大杀器！Covaris truXTRAC® FFPE 方案可处理5~50μm厚FFPE组织样本，并且DNA和RNA可同时提取， AFA超声乳化有多神奇？看下面小视频！20μm厚石蜡组织在超声作用下10秒内乳化成看起来如牛奶般均匀，这些白白的都是脱下来的石蜡小颗粒噢！

3. 蛋白酶K组织消化更彻底！

蛋白酶K消化是为了将DNA与结合的蛋白质分离以及消化样品中可能存在的任何核酸酶，从而防止防止可能带来的核酸降解。保证蛋白酶K与组织充分接触对于消化至关重要！Covaris AFA 超声，使蛋白酶K充分渗入组织内部，帮助消化更彻底。组织消化需要一定时间的孵育，消化孵育时间过短，DNA不能充分释放，将导致核酸提取的得率低。Covaris推荐在前一步加入Covaris truXTRAC®裂解buffer和蛋白酶K再AFA超声处理后56℃下孵育一小时完成组织消化。消化的时间过短，DNA的释放不充分，使核酸得率降低。

4.解交联更温和！

由于FFPE样本制备过程中，甲醛固定使得核酸和蛋白紧密交联，需要将二者解交联。由于前一步组织消化使得样本呈水化状态，因而这一步需要尽量在温和的环境下解交联。一般的试剂盒均是在90℃孵育一小时。Covaris truXTRAC®FFPE核酸提取孵育温度降到80℃，条件更温和，对核酸的损害更小，提高核酸质量！

5.更适合文库测序！

 对于下游应用只做NGS的同志们来说， Covaris truXTRAC®FFPE 核酸提取过程中还可加入Covaris AFA 超声片段化步骤，无需转移操作，减少样本损失和污染的同时还节省打断管。

FFPE样本与新鲜样本提取DNA测序覆盖度比较：其中横坐标表示染色体，深色为覆盖度大于10x的区域，Covaris truXTRAC提取的样本，测序覆盖度更加均一，更接近新鲜的冰冻样本！

基因有限公司作为Covaris公司中国区独家代理商，为您提供更完整的DNA 片段化解决方案，也可为您提供ChIP实验、FFPE样本核酸提取、蛋白提取解决方案等。基因有限公司的宗旨是“专才为专家服务”，有专业团队为各大科研机构提供安装培训，技术支持，应用培训与售后维护一条龙服务，赢得客户的一致好评与信任。想要了解更多，请关注我们的官方微信“基因快讯”或联系您身边的基因有限公司员工。