shERWOOD算法是在对12组各包含25,000个shRNA序列的干扰潜能用sensor assay系统进行高通量同步评估的基础上诞生的。其预测性能较之现有的siRNA预测算法（ie. DSIR）增加了180%，较其他shRNA预测算法的性能提高了126%。Gregory Hannon教授发表的文章中对shERWOOD算法预测文库（transOMIC公司产品）、TRC文库和H-E V3文库的各27,000条shRNA进行了干扰潜能分析，使用shERWOOD算法预测的每一条shRNA干扰效率均在70%以上，干扰效果显著优于其他文库。 

           图1：shERWOOD算法图解

除了算法保证序列有效性，还有哪些设计保证高干扰效果呢？

    将shRNA有效序列嫁接在mir-30的双尾结构表达框架下，这种模拟microRNA更初级转录本的shRNA表达模式可使得shRNA序列在内源性microRNA处理途径的更早期进入整个过程，形成更多功能性的干扰RNA，毒性更低。很多文章已揭示该类型的shRNA设计可显著改善由单纯shRNA累计造成的细胞毒性。对传统mir-30双尾结构进行改造，可显著增加shRNA序列被内源性 Drosha 酶识别和处理的效率。

    Greg教授对更高效地运载shRNA的ultramiR进行研究，将shERWOOD算法预测的海肾荧光素酶的Renilla shRNA和小鼠Rpa3 shRNA分别插入到传统mir30架构与ultramiR架构中，然后，分别对其下游形成的成熟shRNA的水平进行测序，发现shRNA-ultramiR形成的下游成熟shRNA显著多于shRNA-mir30的传统表达模式。

Ø  病毒启动子高效启动 shRNA-ultramir 的表达 

Ø  嘌呤霉素筛选可获得长期稳定沉默的细胞株

Ø  turboGFP 标签可通过荧光观测转染效率 

Ø  多种启动子可选，满足您不同的实验需求

    与目前市面上主流的两大家RNAi工具生厂商的产品进行对比发现，A品牌的TRC文库的shRNA在不同基因中的干扰潜能是不稳定的，产品并没有很好的均一性；B品牌的GIPZ文库中的shRNA在不同基因中的干扰稳定性也不均一，个别基因甚至都没有高效的shRNA产品；而基于shERWOOD算法预测的shRNA与ultramiR的完美结合可以保证在所有基因中的均一、稳定的干扰潜能。

产品形式包括：

Ø人、小鼠和部分大鼠的单个基因的干扰产品 

Ø 人类31个基因家族和通路、1个小鼠基因家族干扰产品套装(提供96孔板形式或混合筛选形式供选择)

Ø 表观遗传学相关基因家族干扰产品套装(包含人类406个基因或小鼠311个基因) 

Ø 人类转录因子相关基因家族干扰产品套装 

Ø transOMIC所有产品均提供序列信息，且可单独购买空载体